KCNK4

KCNK4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3UM7, 4I9W, 4RUE, 4RUF, 4WFE, 4WFF, 4WFG, 4WFH
Ідентифікатори
Символи	KCNK4, K2p4.1, TRAAK, TRAAK1, potassium two pore domain channel subfamily K member 4, FHEIG
Зовнішні ІД	OMIM: 605720 MGI: 1298234 HomoloGene: 7391 GeneCards: KCNK4
Реагує на сполуку
	Рилузол
Онтологія гена
Молекулярна функція	• potassium channel activity; • mechanosensitived potassium channel activity; • voltage-gated ion channel activity; • temperature-gated cation channel activity; • potassium ion leak channel activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • мембрана; • клітинна мембрана; • інтегральний компонент плазматичної мембрани; • potassium channel complex;
Біологічний процес	• sensory perception of temperature stimulus; • regulation of ion transmembrane transport; • cellular response to alkaline pH; • пам'ять; • ion transport; • cellular response to temperature stimulus; • potassium ion transport; • cellular response to mechanical stimulus; • cellular response to fatty acid; • potassium ion transmembrane transport; • Ноцицепція; • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of touch; • stabilization of membrane potential;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	50801
	16528
	ENSG00000182450
	ENSMUSG00000024957
	Q9NYG8
	O88454
	NM_016611; NM_033310; NM_001317090
	NM_008431
	NP_001304019; NP_201567
	NP_032457
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

KCNK4 (англ. Potassium two pore domain channel subfamily K member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 393 амінокислот, а молекулярна маса — 42 704^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRSTTLLALL	ALVLLYLVSG	ALVFRALEQP	HEQQAQRELG	EVREKFLRAH
PCVSDQELGL	LIKEVADALG	GGADPETNST	SNSSHSAWDL	GSAFFFSGTI
ITTIGYGNVA	LRTDAGRLFC	IFYALVGIPL	FGILLAGVGD	RLGSSLRHGI
GHIEAIFLKW	HVPPELVRVL	SAMLFLLIGC	LLFVLTPTFV	FCYMEDWSKL
EAIYFVIVTL	TTVGFGDYVA	GADPRQDSPA	YQPLVWFWIL	LGLAYFASVL
TTIGNWLRVV	SRRTRAEMGG	LTAQAASWTG	TVTARVTQRA	GPAAPPPEKE
QPLLPPPPCP	AQPLGRPRSP	SPPEKAQPPS	PPTASALDYP	SENLAFIDES
SDTQSERGCP	LPRAPRGRRR	PNPPRKPVRP	RGPGRPRDKG	VPV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Lesage F., Maingret F., Lazdunski M. (2000). Cloning and expression of human TRAAK, a polyunsaturated fatty acids-activated and mechano-sensitive K(+) channel. FEBS Lett. 471: 137—140. PMID 10767409 doi:10.1016/S0014-5793(00)01388-0
Ozaita A., Vega-Saenz de Miera E. (2002). Cloning of two transcripts, HKT4.1a and HKT4.1b, from the human two-pore K+ channel gene KCNK4. Chromosomal localization, tissue distribution and functional expression. Brain Res. Mol. Brain Res. 102: 18—27. PMID 12191490 doi:10.1016/S0169-328X(02)00157-2
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1 — R8.16. PMID 14759258 doi:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Brohawn S.G., del Marmol J., MacKinnon R. (2012). Crystal structure of the human K2P TRAAK, a lipid- and mechano-sensitive K+ ion channel. Science. 335: 436—441. PMID 22282805 doi:10.1126/science.1213808
Brohawn S.G., Campbell E.B., MacKinnon R. (2013). Domain-swapped chain connectivity and gated membrane access in a Fab-mediated crystal of the human TRAAK K+ channel. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110: 2129—2134. PMID 23341632 doi:10.1073/pnas.1218950110
Brohawn S.G., Campbell E.B., MacKinnon R. (2014). Physical mechanism for gating and mechanosensitivity of the human TRAAK K+ channel. Nature. 516: 126—130. PMID 25471887 doi:10.1038/nature14013

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium two pore domain channel subfamily K member 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6279 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NYG8 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium two pore domain channel subfamily K member 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6279 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q9NYG8 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]