CLCA4

CLCA4
Ідентифікатори
Символи	CLCA4, CaCC, CaCC2, chloride channel accessory 4
Зовнішні ІД	OMIM: 616857 MGI: 2139744 HomoloGene: 40808 GeneCards: CLCA4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • гідролазна активність • metallopeptidase activity • зв’язування з іоном металу • активність хлоридного каналу • metalloendopeptidase activity • intracellular calcium activated chloride channel activity Клітинна компонента • інтегральний компонент мембрани • extracellular region • клітинна мембрана • інтегральний компонент плазматичної мембрани • apical plasma membrane • мембрана Біологічний процес • ion transmembrane transport • chloride transport • протеоліз • chloride transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22802	99663
Ensembl	ENSG00000016602	ENSMUSG00000068547
UniProt	Q14CN2	Q6Q473
RefSeq (мРНК)	NM_012128	NM_207208
RefSeq (білок)	NP_036260	NP_997091
Локус (UCSC)	Хр. 1: 86.55 – 86.58 Mb	Хр. 3: 144.66 – 144.68 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLCA4 (англ. Chloride channel accessory 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 919 амінокислот, а молекулярна маса — 101 283.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGLFRGFVFL		LVLCLLHQSN		TSFIKLNNNG		FEDIVIVIDP		SVPEDEKIIE
QIEDMVTTAS		TYLFEATEKR		FFFKNVSILI		PENWKENPQY		KRPKHENHKH
ADVIVAPPTL		PGRDEPYTKQ		FTECGEKGEY		IHFTPDLLLG		KKQNEYGPPG
KLFVHEWAHL		RWGVFDEYNE		DQPFYRAKSK		KIEATRCSAG		ISGRNRVYKC
QGGSCLSRAC		RIDSTTKLYG		KDCQFFPDKV		QTEKASIMFM		QSIDSVVEFC
NEKTHNQEAP		SLQNIKCNFR		STWEVISNSE		DFKNTIPMVT		PPPPPVFSLL
KISQRIVCLV		LDKSGSMGGK		DRLNRMNQAA		KHFLLQTVEN		GSWVGMVHFD
STATIVNKLI		QIKSSDERNT		LMAGLPTYPL		GGTSICSGIK		YAFQVIGELH
SQLDGSEVLL		LTDGEDNTAS		SCIDEVKQSG		AIVHFIALGR		AADEAVIEMS
KITGGSHFYV		SDEAQNNGLI		DAFGALTSGN		TDLSQKSLQL		ESKGLTLNSN
AWMNDTVIID		STVGKDTFFL		ITWNSLPPSI		SLWDPSGTIM		ENFTVDATSK
MAYLSIPGTA		KVGTWAYNLQ		AKANPETLTI		TVTSRAANSS		VPPITVNAKM
NKDVNSFPSP		MIVYAEILQG		YVPVLGANVT		AFIESQNGHT		EVLELLDNGA
GADSFKNDGV		YSRYFTAYTE		NGRYSLKVRA		HGGANTARLK		LRPPLNRAAY
IPGWVVNGEI		EANPPRPEID		EDTQTTLEDF		SRTASGGAFV		VSQVPSLPLP
DQYPPSQITD		LDATVHEDKI		ILTWTAPGDN		FDVGKVQRYI		IRISASILDL
RDSFDDALQV		NTTDLSPKEA		NSKESFAFKP		ENISEENATH		IFIAIKSIDK
SNLTSKVSNI		AQVTLFIPQA		NPDDIDPTPT		PTPTPTPDKS		HNSGVNISTL
VLSVIGSVVI		VNFILSTTI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Agnel M., Vermat T., Culouscou J.-M. (1999). Identification of three novel members of the calcium-dependent chloride channel (CaCC) family predominantly expressed in the digestive tract and trachea. FEBS Lett. 455: 295—301. PMID 10437792 doi:10.1016/S0014-5793(99)00891-1
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1