FOXI1

FOXI1
Ідентифікатори
Символи	FOXI1, FKH10, FKHL10, FREAC-6, FREAC6, HFH-3, HFH3, forkhead box I1
Зовнішні ІД	OMIM: 601093 MGI: 1096329 HomoloGene: 8140 GeneCards: FOXI1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • специфічне до послідовності зв'язування з ДНК • зв'язування з ДНК • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding, bending • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • ядерце • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • inner ear morphogenesis • ДНК-матрична транскрипція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин • embryo development ending in birth or egg hatching • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2299	14233
Ensembl	ENSG00000168269	ENSMUSG00000047861
UniProt	Q12951	Q922I5
RefSeq (мРНК)	NM_012188 NM_144769	NM_023907
RefSeq (білок)	NP_036320 NP_658982	NP_076396
Локус (UCSC)	Хр. 5: 170.11 – 170.11 Mb	Хр. 11: 34.15 – 34.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FOXI1 (англ. Forkhead box I1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 378 амінокислот, а молекулярна маса — 40 973.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSFDLPAPS		PPRCSPQFPS		IGQEPPEMNL		YYENFFHPQG		VPSPQRPSFE
GGGEYGATPN		PYLWFNGPTM		TPPPYLPGPN		ASPFLPQAYG		VQRPLLPSVS
GLGGSDLGWL		PIPSQEELMK		LVRPPYSYSA		LIAMAIHGAP		DKRLTLSQIY
QYVADNFPFY		NKSKAGWQNS		IRHNLSLNDC		FKKVPRDEDD		PGKGNYWTLD
PNCEKMFDNG		NFRRKRKRKS		DVSSSTASLA		LEKTESSLPV		DSPKTTEPQD
ILDGASPGGT		TSSPEKRPSP		PPSGAPCLNS		FLSSMTAYVS		GGSPTSHPLV
TPGLSPEPSD		KTGQNSLTFN		SFSPLTNLSN		HSGGGDWANP		MPTNMLSYGG
SVLSQFSPHF		YNSVNTSGVL		YPREGTEV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Overdier D.G., Ye H., Peterson R.S., Clevidence D.E., Costa R.H. (1997). The winged helix transcriptional activator HFH-3 is expressed in the distal tubules of embryonic and adult mouse kidney. J. Biol. Chem. 272: 13725—13730. PMID 9153225 doi:10.1074/jbc.272.21.13725
• Pierrou S., Hellqvist M., Samuelsson L., Enerbaeck S., Carlsson P. (1994). Cloning and characterization of seven human forkhead proteins: binding site specificity and DNA bending. EMBO J. 13: 5002—5012. PMID 7957066

Див. також

• Хромосома 5