fastq转fasta代码-基于perl

最新推荐文章于 2026-06-07 18:28:44 发布

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介绍了一个使用Perl编写的脚本，用于将fastq格式的生物信息学数据转换为fasta格式。代码可在zlab的GitHub仓库中找到。

#! /usr/bin/perl

use strict;
use warnings;
use List::Util qw(sum min max);
use Getopt::Long;
use File::Basename;

# Parameter variables
my $file;
my $helpAsked;
my $outFile = "";

GetOptions(
			"i=s" => \$file,
			"h|help" => \$helpAsked,
			"o|outputFile=s" => \$outFile,
		  );
if(defined($helpAsked)) {
   
   
	prtUsage();
	exit;