医学图像处理:Ubuntu16.04安装freesurfer教程

Ubuntu系统下freesurfer安装 找到适合自己系统的版本,我下载的是tar.gz文件,其他的文件应该只是压缩方式不同。====================注册=======================================配置======================================下载===================(.bashrc文件是隐藏文件,可以在图形界面中显示隐藏文件,双击进入修改;找到主目录下的.bashrc文件,打开它,把下面的代码添加到文件末尾。有其他报错的话,应该都是这样处理。 阅读详情
freesurfer是一个处理大脑3D数据影像的软件,用起来非常方便。安装教程如下:

我的ubuntu系统是16.04,其他版本亦可作为参考。

1.下载所需软件包

在官网上下载安装包,链接:点击打开链。下载需要12个小时左右。

获取licence,在官网点击打开链接上注册一下,填写自己的邮箱,提交之后会收到一个邮件。打开附件,复制附件信息,新建一个licence.txt,将内容粘贴到该txt文件中。


收到的邮件如下



2.安装包复制与解压

将下载的软件包复制到/usr/local下,要保证有足够大的空间。在ubuntu系统下打开命令窗口,输入

sudo cp 安装包名字 /usr/local 

这里安装包名字不仅要是全称,还要将位置信息打上去(如果你进的是该安装包目录下就不用了)。

解压:输入

Freesurfer简介及学习推荐 Freesurfer是用于MRI图像处理和分析的一款开源软件,可以进行多种模态数据的预处理、皮层重建、volume与surface的互相 之间的配准等。Freesurfer许多功能都可以利用软件包中集成好的pipeline来实现,可以参考官网进行了解,也可以调用一些单独的命令来实现自己的需求,比如查看.mgz/.nii.gz等格式文件的信息时用到的mri_info等。具体介... 阅读详情

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uinglin
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