TxGNN 架构深度拆解与 Zero-Shot 复现

1. 核心要点概括

  1. 解决的核心痛点:传统药物重定位模型高度依赖“已知药物”特征,遇到无已知疗法的零样本疾病(Zero-Shot Disease)时预测能力骤降。TxGNN 专门为此场景设计。
  2. 统一预测框架:在生物医学知识图谱 PrimeKG 上统一建模适应症(Indication)禁忌症(Contraindication)超说明书用药(Off-label use)
  3. 主干架构2 层 HeteroRGCN + 度量学习疾病原型增强(Disease Prototype) + DistMult 解码器,并支持事后提取多跳路径解释(GraphMask)。
  4. 两阶段训练:整图全关系预训练(Pretrain)学通用实体表示 →\rightarrow
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