在Eclipse中运行Ant

生信物种注释软件Kraken2+Bracken的安装与使用 一、软件安装与数据库下载 1.Kraken2安装 Kraken2是一个基于k-mer算法的高精度宏基因组序列分类软件,能够快速的将测序reads进行物种分类。 使用conda一键安装,要先安装好anaconda或者miniconda conda install -y kraken2 输入krakek2 --help 出现如下所示帮助文档,则表示安装成功。 2.Bracken安装 bracken是一种从宏基因组数据中高度准确的计算物种丰度的统计方法。 同样使用conda一键安装 conda install - 阅读详情

Eclipse中已经内置了Ant支持。在project中新建一个build.xml,双击Eclipse就会用AntEditor打开编辑。右键点击build.xmlRun Ant,在谈出的对话框中可以设置调用参数、运行目录、运行的Target、类路径、属性等。

设置好了之后,Run就行了。在输出窗口中可以看到输出结果,并且输出结果是链接到编辑器的。例如对 [delete] Deleting 2 files from E:/eclipse/workspace/testant,点击[delete],在Ant Editor中就可以定位到对应的delete任务。运行过一次以后,在Run > External Tools中就保存了运行设置,再运行Run一下就行了。

 

Ant设置

Window > Preferences > Ant 中有许多Ant配置参数。

一个是”Names”,指定什么样的xml文件用Ant Editor打开,什么样的文件用一般的XML Editor打开。缺省是”build.xml”,可以设置为用逗号分隔的名称,如”build.xml”, “dist.xml”等。

如果需要使用外部的任务(参见“Ant高级特性:使用外部Task”),那么需要设置Ant运行时的ClassPath

Add JARs Add Folder指向依赖的外部类库。

02-eclipse中构建ant项目和编译运行ant Eclipse中已经集成Ant,我们可以直接在Eclipse运行Ant。 1、用 Ant 来构建简单系统 新建一个 Java project, 命名为Hello Hello .java 文件内容 package example; public class Hello { public static void main(String[] args) { 阅读详情

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blundblade
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