近年来，随着测序成本的不断降低，转录组测序已经成为解析基因组的功能成分、揭示细胞和组织的分子成分以及理解发育和疾病必不可少的技术手段，已广泛应用于基础研究、临床诊断等领域。发表论文作为检验研究成果的一条重要途径，大家都在思考高分文章到底该从何入手，一方面需要全面、细致的实验设计，但另一方面，区别于常规的分析内容，清晰明了又好看的结果图片也都会为文章添砖加瓦！那转录组测序除了常见的差异基因通路富集及结构分析之外，还有哪些适用的分析内容呢？
本文给大家带来“转录组时序分析”实操，希望给各位老师数据分析带来一些帮助。更多转录组个性化分析内容，后续将陆续推送，大家敬请期待！
1.时间序列分析的意义
1）将表达相似的基因聚集为1类，表达相似的基因可能具有相似的生物学功能或者共同的细胞起源；
2）基因调控的顺序，基因间存在诱导或者阻遏；
3）同一种处理在不同的时间下，生物学动态变化。
2.Mfuzz软件包
Mfuzz是专门的做转录变化的时间趋势分析的方法，核心算法基于模糊c均值聚类（Fuzzy C-Means Clustering，FCM），是基于R编程的软件包。
聚类方法：如果一个聚类方法假定一个样本只能属于一个类，或类的交集为空集，那么该方法称为硬聚类（hard clustering）方法；如果一个样本可以属于多个类，或类的交集不为空集，那么该方法称为软聚类（soft clustering）方法。
3.Mfuzz包安装及加载
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