GNN图神经网络的应用及MATLAB仿真

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本文介绍了如何在MATLAB中利用GNN工具箱对PPI数据集进行图神经网络的训练和预测。通过五个步骤：准备工作、数据读取、模型构建、模型训练和测试，详细阐述了GNN在蛋白质相互作用分析中的应用。

GNN图神经网络的应用及MATLAB仿真

在人工智能领域，GNN图神经网络是一种基于信息扩散机制的神经网络模型。这种模型可以用于建立图结构来描述复杂系统中各个节点之间的关系以及节点间的信息传递。如果要进行GNN图神经网络的应用及MATLAB仿真，首先需要掌握MATLAB工具箱的使用方法。

本文将以"PPI数据集"为例子，介绍如何使用GNN工具箱和MATLAB仿真，来训练和预测蛋白质相互作用。我们将使用Matlab R2019b版本，并假设已经安装了"Deep Learning Toolbox"和"GNN工具箱"。让我们开始吧！

1、准备工作

首先，我们需要下载"PPI数据集"。可以从网站（https://string-db.org/）上找到该数据集并下载。解压文件后，可以看到里面包含有train.txt和test.txt两个文件。

2、读取数据

首先读取train.txt文件，并将其转换为Matlab中的table格式。

fileID=fopen('train.txt','r');
str=fread(fileID,inf,'*char').';
fclose(fileID);
edges=split(str,newline); edges(1)=[];
edges=cellfun(@(x) split(x),edges,'UniformOutput',false);
edges(cellfun(@(x) strcmp(x{3},'0'),edges),:)=[];
edges=cellfun(@(x) [st

标签

#matlab #神经网络 #机器学习

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GNN图神经网络工具箱的应用和MATLAB仿真

DevScribe的博客

09-07

1357

然后，我们定义了GCN模型的参数，包括隐藏层维度和输出层维度。通过以上的代码示例，我们展示了如何使用GNN图神经网络工具箱在MATLAB中构建、训练和评估GNN模型。当然，GNN图神经网络工具箱还提供了其他功能和工具，例如不同类型的GNN模型、图数据预处理函数等，可以根据具体的需求进行使用。总结起来，GNN图神经网络工具箱为MATLAB用户提供了方便易用的工具和函数，用于开发和应用GNN模型。希望本文能够帮助读者了解GNN图神经网络工具箱的应用和MATLAB仿真，并为进一步的研究和开发提供指导和参考。

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GNN图神经网络的MATLAB仿真

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matlabauc代码-Hash-GNN:散列神经网络

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【GNN】GNN图神经网络工具箱的应用和matlab仿真

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SimonChen

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